El INIA-CENIAP Sanidad Animal (antes Instituto de Investigaciones Veterinarias), a lo largo de su historia ha contribuido de manera significativa con la salud animal del país, aportando grandes logros en la prevención, control y/o erradicación de diversas enfermedades que atacan a los animales, participando en los programas y campañas sanitarias que llevan a cabo los organismos oficiales encargados de la salud animal del país. 

Como misión fundamental desde su creación ha sido la de contribuir con el desarrollo agroalimentario del país, mediante el diagnóstico certero, eficaz y confiable de las principales patologías animales que afectan a nuestra ganadería, lo cual ha permitido desde sus inicios contribuir, entre otras cosas con:

• La elaboración por primera vez en el país de la vacuna contra la brucelosis y el antígeno de Bang.

• La realización de estudios epidemiológicos sobre determinadas patologías  como: leptospirosis, fiebre aftosa, estomatitis vesicular, rabia, leucosis enzootica, paratuberculosis, rinotraqueitis infecciosa bovina, etc. algunas de estas en la actualidad en proceso de erradicación.

• En el caso de las parasitosis se desarrolló en laboratorio y campo con resultados satisfactorios, la vacuna contra la babesiosis bovina.

• Ampliación de conocimientos sobre la epidemiología de la helmintosis en grupos etarios y zonas especificas del país, especialmente en bovinos de doble propósito, lo cual facilitó la aplicación de tratamientos estratégicos y específicos en determinadas edades y ciclo de tiempo.

• Interacción positiva entre el sector privado dedicado a la producción de cerdos y nuestra institución, lo que ha determinado la prevalencia de muchas enfermedades virales y bacterianas que afectan al rubro y ha permitido proponer estrategias de control sanitario y aplicación de tratamientos específicos que colaboran en mantener una rentabilidad en este sector tan afectado económicamente.

• El desarrollo de la vacuna de Newcastle y la elaboración de la vacuna a virus vivo contra la encefalomielitis aviar, contribuyeron a la implementación y consolidación de la explotación avícola a nivel nacional, además de otras acciones como: aislamiento del virus de la enfermedad infecciosa de la bursa (Gumboro), aislamiento de Pasteurella gallinarum en codornices, y reconocimientos de nuevos serotipos de Salmonellas.

• En peces se reportó por primera vez en truchas el agente etiológico de la enfermedad entérica de la boca roja (Yersinia ruckeri), permitiendo establecer las medidas sanitarias para su control. 

Todas estas acciones han permitido consolidar un liderazgo nacional con respecto a los diagnósticos de las enfermedades de origen animal, que mantiene al CENIAP como institución confiable y eficaz para dar respuesta a cualquier situación emergente que afecte nuestra ganadería, incrementándose con el correr de los años el número de muestras recibidas anualmente.  

Durante el quinquenio 2000–2004, se evaluó un promedio de 4.307 diferentes muestras (sueros, sangre, cerebros, vísceras, heces, animal vivo, cadáveres, etc), sobre las cuales se realizaron pruebas diagnósticas para anatomía patológica, bacteriología, parasitología y virología, observándose en el año 2004 el mayor número de muestras evaluadas (5.125) en el período (Ver Tabla I, Figura 1). Las variaciones en el número de muestras evaluadas por año, dependieron de diversos factores como por ejemplo, la ocurrencia de algún brote de determinada enfermedad (epidemia de fiebre aftosa, de encefalitis equina), o la puesta en marcha de algún programa sanitario específico (nuevas reglamentaciones en el control de brucelosis, leptospirosis, anemia infecciosa equina), o problemas de índole socio-político (2003) que pudieron influir negativamente en la normal recolección y envío de muestras.  

En las figuras 2, 3, 4 y 5 se observan la variación en el quinquenio 2000–2004, del número de muestras por especie animal (bovinos, equinos, aves y suinos), y en las tablas II, III, IV y V se aprecian los diagnósticos mas importantes efectuados en ese período, en estos rubros.